診斷試劑
diagnosis
背景
腫瘤標(biāo)志物是指在惡性腫瘤的發(fā)生和增殖過(guò)程中,由腫瘤細(xì)胞本身所產(chǎn)生的或是由機(jī)體對(duì)腫瘤細(xì)胞反應(yīng)而異常產(chǎn)生和(或)升高的,反映腫瘤存在和生長(zhǎng)的一類物質(zhì),包括蛋白質(zhì)、激素、酶(同工酶)、多胺及癌基因產(chǎn)物等,存在于患者的血液、體液、細(xì)胞或組織中,可用生物化學(xué)、免疫學(xué)及分子生物學(xué)等方法進(jìn)行測(cè)定,對(duì)腫瘤的輔助診斷、鑒別診斷、療效觀察、復(fù)發(fā)監(jiān)測(cè)以及預(yù)后評(píng)估具有一定的臨床診療價(jià)值。
熱門腫瘤標(biāo)志物
MRD是指治療后體內(nèi)殘留的腫瘤細(xì)胞或者標(biāo)志物,通常的翻譯有3種,微小殘留病灶(Minimal Residual Disease)、可檢測(cè)殘留病灶(Measurable Residual Disease)、分子殘留病灶(Molecular Residual Disease)。
現(xiàn)有的針對(duì)ctDNA的MRD檢測(cè)主要有2條技術(shù)路線:tumor-agnostic -assays(腫瘤未知分析)和tumor-informed assays(腫瘤知情/先驗(yàn)分析),其中tumor-agnostic -assays僅對(duì)血漿檢測(cè),利用的是固定的panel(一般為驅(qū)動(dòng)基因和靶向藥物基因,也會(huì)多組學(xué)方法)和分析方法對(duì)ctDNA做檢測(cè),做分析,代表產(chǎn)品Guardant Health公司的Guardant Reveal;tumor-informed assays需要對(duì)原發(fā)腫瘤組織進(jìn)行測(cè)序(一般為WES),來(lái)鑒定患者的特異基因組變異圖譜,然后再定制個(gè)性化的panel,針對(duì)ctDNA做檢測(cè),也就是說(shuō)需要對(duì)組織和血漿都做檢測(cè),代表產(chǎn)品為Natera公司的Signatera。
MRD技術(shù)難度很大的一個(gè)方面是對(duì)超低頻突變的檢測(cè)能力和穩(wěn)定性,以非小細(xì)胞肺癌為例,在早期NSCLC患者血漿中位cfDNA的濃度為7.69 ng/mL,換算在10 mL血漿(20ml全血)中含有大概20,000個(gè)單倍體基因組(3.3pg),考慮到cfDNA建庫(kù)時(shí)的損耗以及至少存在2條相同的變異基因序列,10 mL血漿中ctDNA檢測(cè)到的極限分子信號(hào)為0.02%水平,另外, 從TRACERx研究數(shù)據(jù)推算, 在1 cm3體積的腫瘤情況下, 10 mL血漿中大概含有2條腫瘤來(lái)源DNA分子。因此, 在NSCLC中進(jìn)行MRD檢測(cè)時(shí), 該檢測(cè)方法必須可穩(wěn)定檢測(cè)出豐度≥ 0.02%的ctDNA。這里有個(gè)重要的技術(shù)策略,就是Sample Level的策略,對(duì)于Site level的0.02%甚至更低,可以通過(guò)Samples Level來(lái)提高靈敏度。
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