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SARS-Panel Pseudovirus Standard Reference

CBV30024

詢 價(jià)
留 言
產(chǎn)品描述
產(chǎn)品數(shù)據(jù)庫

 

I. 背景

Severe acute respiratory syndrome (SARS)2003年二月在亞洲第一次被報(bào)道,繼而傳播到全球十幾個(gè)國家,SARS屬于一種冠狀病毒,是一類具有囊膜、基因組為線性單股正鏈的RNA病毒,對(duì)應(yīng)的結(jié)構(gòu)示意圖如下:

根據(jù)CDCWHO的介紹,針對(duì)SARS的核酸診斷一般是針對(duì)ORF1ab/RdRP(RNA-dependent RNA polymerase)、Gene N、Gene M和Gene E, Gene S更多用于對(duì)應(yīng)藥物和疫苗的開發(fā)。NCBI收錄序列為NC_004718.3,全長(zhǎng)29751bp,基因編碼4個(gè)結(jié)構(gòu)蛋白:S,MNE。

試劑盒的檢測(cè)限問題,是造成假陰性的最大根源,因此針對(duì)診斷產(chǎn)品的檢測(cè)限,我們需要認(rèn)真做每款試劑盒的性能評(píng)價(jià)。以往針對(duì)檢測(cè)限的性能評(píng)價(jià),一般是選擇體外轉(zhuǎn)錄的RNA、或者臨床陽性病毒來作為標(biāo)準(zhǔn)品,用于性能評(píng)價(jià)。但是兩者都具有很明顯的確定,首先體外轉(zhuǎn)錄的RNA,一般是很純,單一,不涉及提取,不符合臨床病毒的微環(huán)境,因此必然造成檢測(cè)靈敏度被高估,這也是存在高概率假陰性的主要原因;再次臨床陽性病毒,即使是滅活的病毒,也是存在很大的生物安全隱患,因此要求實(shí)驗(yàn)室級(jí)別為P3-P4,大部分開發(fā)診斷試劑盒單位都不滿足改要求,另外臨床陽性病毒也是來源很有限,不能被穩(wěn)定供應(yīng),反復(fù)用于試劑盒的性能評(píng)價(jià)。

 
II.產(chǎn)品描述

有病毒的完整包膜結(jié)構(gòu),有SARS對(duì)應(yīng)的核酸序列,但是生物安全風(fēng)險(xiǎn)較低的假病毒標(biāo)準(zhǔn)品,完美的克服了選擇體外轉(zhuǎn)錄的RNA、或者臨床陽性病毒來作為標(biāo)準(zhǔn)品的缺點(diǎn),非常適合用于核酸診斷性能評(píng)價(jià)的標(biāo)準(zhǔn)品。

構(gòu)建過程:SARS基因合成→假病毒包裝→純化→QC檢測(cè)(ddPCR)

 
III. 產(chǎn)品介紹
產(chǎn)品名稱: SARS-Panel Pseudovirus Standard Reference
對(duì)應(yīng)序列(詳情見附錄):

ORF1ab/RdRP(2795bp)、Gene M(666bp)、Gene N(1207bp)、Gene E(231bp)

產(chǎn)品規(guī)格: 1ml
拷貝數(shù):  
生物安全級(jí)別: P2
運(yùn)輸與保存方式: 干冰運(yùn)輸,-90 ~ -70°C保存
有效期:  
 
IV. 產(chǎn)品用途與優(yōu)勢(shì)
產(chǎn)品用途: SARS診斷試劑盒性能評(píng)價(jià)
產(chǎn)品優(yōu)勢(shì): • SARS的假病毒標(biāo)準(zhǔn)品,區(qū)別于以往體外合成的RNA、臨床陽性活病毒,完美克服兩者的缺點(diǎn),真正適合用于試劑盒的性能評(píng)價(jià),包含檢測(cè)限、特異性,重復(fù)性等;

• 根據(jù)SARS冠狀病毒的特點(diǎn),選取了ORF1ab/RdRP(RNA-dependent RNA polymerase)、Gene E(envelope protein)、Gene N(nucleocapsid phosphoprotein)、Gene M合計(jì)4個(gè)區(qū)段的序列,用于假病毒的包裝,4個(gè)區(qū)段很好的表征了SARS的特征序列;

• 科佰生物設(shè)計(jì)了ddPCR體系的引物、探針序列,可不需要構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)曲線的前提下完成對(duì)假病毒的QC拷貝數(shù)檢測(cè),非常準(zhǔn)確表征標(biāo)準(zhǔn)品的拷貝數(shù),而且克服了Q-PCR分析CT值的相對(duì)判斷標(biāo)準(zhǔn)的不準(zhǔn)確性;

• 假病毒標(biāo)準(zhǔn)品,無致病性,可再生,質(zhì)控方法可靠,批次間穩(wěn)定,可以長(zhǎng)期穩(wěn)定制備和供應(yīng),而且要求實(shí)驗(yàn)室生物安全級(jí)別為P2,滿足很多單位的安全需求。

 
Ⅴ. 附錄

ORF1ab/RdRP:

TCTGCGGATGCATCAACGTTTTTAAACGGGTTTGCGGTGTAAGTGCAGCCCGTCTTACACCGTGCGGCACAGGCACTAGTACTGATGTCGTCTACAGGGCTTTTGATATTTACAACGAAAAAG

TTGCTGGTTTTGCAAAGTTCCTAAAAACTAATTGCTGTCGCTTCCAGGAGAAGGATGAGGAAGGCAATTTATTAGACTCTTACTTTGTAGTTAAGAGGCATACTATGTCTAACTACCAACATG

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TGACTAGGGCATTGGCTGCTGAGTCCCATATGGATGCTGATCTCGCAAAACCACTTATTAAGTGGGATTTGCTGAAATATGATTTTACGGAAGAGAGACTTTGTCTCTTCGACCGTTATTTTA

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AACTTTTAGTGTATGCTGCTGATCCAGCTATGCATGCAGCTTCTGGCAATTTATTGCTAGATAAACGCACTACATGCTTTTCAGTAGCTGCACTAACAAACAATGTTGCTTTTCAAACTGTCA

AACCCGGTAATTTTAATAAAGACTTTTATGACTTTGCTGTGTCTAAAGGTTTCTTTAAGGAAGGAAGTTCTGTTGAACTAAAACACTTCTTCTTTGCTCAGGATGGCAACGCTGCTATCAGTG

ATTATGACTATTATCGTTATAATCTGCCAACAATGTGTGATATCAGACAACTCCTATTCGTAGTTGAAGTTGTTGATAAATACTTTGATTGTTACGATGGTGGCTGTATTAATGCCAACCAAG

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GTTGGGATTATCCAAAATGTGACAGAGCCATGCCTAACATGCTTAGGATAATGGCCTCTCTTGTTCTTGCTCGCAAACATAACACTTGCTGTAACTTATCACACCGTTTCTACAGGTTAGCTA

ACGAGTGTGCGCAAGTATTAAGTGAGATGGTCATGTGTGGCGGCTCACTATATGTTAAACCAGGTGGAACATCATCCGGTGATGCTACAACTGCTTATGCTAATAGTGTCTTTAACATTTGTC

AAGCTGTTACAGCCAATGTAAATGCACTTCTTTCAACTGATGGTAATAAGATAGCTGACAAGTATGTCCGCAATCTACAACACAGGCTCTATGAGTGTCTCTATAGAAATAGGGATGTTGATC

ATGAATTCGTGGATGAGTTTTACGCTTACCTGCGTAAACATTTCTCCATGATGATTCTTTCTGATGATGCCGTTGTGTGCTATAACAGTAACTATGCGGCTCAAGGTTTAGTAGCTAGCATTA

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TGGCTATTGATGCTTACCCACTTACAAAACATCCTAATCAGGAGTATGCTGATGTCTTTCACTTGTATTTACAATACATTAGAAAGTTACATGATGAGCTTACTGGCCACATGTTGGACATGT

ATTCCGTAATGCTAACTAATGATAACACCTCACGGTACTGGGAACCTGAGTTTTATGAGGCTATGTACACACCACATACAGTCTTGCAG

 

 

Gene M:

ATGGCAGACAACGGTACTATTACCGTTGAGGAGCTTAAACAACTCCTGGAACAATGGAACCTAGTAATAGGTTTCCTATTCCTAGCCTGGATTATGTTACTACAATTTGCCTATTCTAATCGG

AACAGGTTTTTGTACATAATAAAGCTTGTTTTCCTCTGGCTCTTGTGGCCAGTAACACTTGCTTGTTTTGTGCTTGCTGCTGTCTACAGAATTAATTGGGTGACTGGCGGGATTGCGATTGCA

ATGGCTTGTATTGTAGGCTTGATGTGGCTTAGCTACTTCGTTGCTTCCTTCAGGCTGTTTGCTCGTACCCGCTCAATGTGGTCATTCAACCCAGAAACAAACATTCTTCTCAATGTGCCTCTC

CGGGGGACAATTGTGACCAGACCGCTCATGGAAAGTGAACTTGTCATTGGTGCTGTGATCATTCGTGGTCACTTGCGAATGGCCGGACACTCCCTAGGGCGCTGTGACATTAAGGACCTGCCA

AAAGAGATCACTGTGGCTACATCACGAACGCTTTCTTATTACAAATTAGGAGCGTCGCAGCGTGTAGGCACTGATTCAGGTTTTGCTGCATACAACCGCTACCGTATTGGAAACTATAAATTA

AATACAGACCACGCCGGTAGCAACGACAATATTGCTTTGCTAGTACAGTAA

 

Gene N:

ATGTCTGATAATGGACCCCAATCAAACCAACGTAGTGCCCCCCGCATTACATTTGGTGGACCCACAGATTCAACTGACAATAACCAGAATGGAGGACGCAATGGGGCAAGGCCAAAACAGCGC

CGACCCCAAGGTTTACCCAATAATACTGCGTCTTGGTTCACAGCTCTCACTCAGCATGGCAAGGAGGAACTTAGATTCCCTCGAGGCCAGGGCGTTCCAATCAACACCAATAGTGGTCCAGAT

GACCAAATTGGCTACTACCGAAGAGCTACCCGACGAGTTCGTGGTGGTGACGGCAAAATGAAAGAGCTCAGCCCCAGATGGTACTTCTATTACCTAGGAACTGGCCCAGAAGCTTCACTTCCC

TACGGCGCTAACAAAGAAGGCATCGTATGGGTTGCAACTGAGGGAGCCTTGAATACACCCAAAGACCACATTGGCACCCGCAATCCTAATAACAATGCTGCCACCGTGCTACAACTTCCTCAA

GGAACAACATTGCCAAAAGGCTTCTACGCAGAGGGAAGCAGAGGCGGCAGTCAAGCCTCTTCTCGCTCCTCATCACGTAGTCGCGGTAATTCAAGAAATTCAACTCCTGGCAGCAGTAGGGGA

AATTCTCCTGCTCGAATGGCTAGCGGAGGTGGTGAAACTGCCCTCGCGCTATTGCTGCTAGACAGATTGAACCAGCTTGAGAGCAAAGTTTCTGGTAAAGGCCAACAACAACAAGGCCAAACT

GTCACTAAGAAATCTGCTGCTGAGGCATCTAAAAAGCCTCGCCAAAAACGTACTGCCACAAAACAGTACAACGTCACTCAAGCATTTGGGAGACGTGGTCCAGAACAAACCCAAGGAAATTTC

GGGGACCAAGACCTAATCAGACAAGGAACTGATTACAAACATTGGCCGCAAATTGCACAATTTGCTCCAAGTGCCTCTGCATTCTTTGGAATGTCACGCATTGGCATGGAAGTCACACCTTCG

GGAACATGGCTGACTTATCATGGAGCCATTAAATTGGATGACAAAGATCCACAATTCAAAGACAACGTCATACTGCTGAACAAGCACATTGACGCATACAAAACATTCCCACCAACAGAGCCT

AAAAAGGACAAAAAGAAAAAGACTGATGAAGCTCAGCCTTTGCCGCAGAGACAAAAGAAGCAGCCCACTGTGACTCTTCTTCCTGCGGCTGACATGGATGATTTCTCCAGACAACTTCAAAAT

TCCATGAGTGGAGCTTCTGCTGATTCAACTCAGGCATAA

 

Gene E:

atgtactcattcgtttcggaagaaacaggtacgttaatagttaatagcgtacttctttttcttgctttcgtggtattcttgctagtcacactagccatccttactgcgcttcgattgtgtgcg

tactgctgcaatattgttaacgtgagtttagtaaaaccaacggtttacgtctactcgcgtgttaaaaatctgaactcttctgaaggagttcctgatcttctggtctaa

 

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