細胞RNAi技術(shù)
▏ RNAi技術(shù)服務(wù)
近年來的研究表明,將與mRNA同源的正義RNA和反義RNA組成的雙鏈RNA(dsRNA)導入細胞,可以使mRNA發(fā)生特異性的降解,從而抑制其相應基因的表達。這種轉(zhuǎn)錄后基因沉默機制(Post-transcriptional gene silencing, PTGS)被稱為RNA干擾(RNAi)。由于RNAi具有高度的序列專一性,可以特異地使特定基因沉默,獲得功能喪失或降低突變,因此RNAi可以作為一種強有力的研究工具,用于功能基因組的研究。
科佰生物應用國外知名公司的RNAi Designer平臺,可對靶基因序列進行干擾位置效應評價和序列同源型分析,完成siRNA/miRNA多種序列的的設(shè)計,并提供從siRNA合成、RNAi載體構(gòu)建到RNAi功能驗證等全面的RNAi解決方案。
▏ siRNA合成服務(wù)
對于瞬時基因沉默實驗,化學合成siRNA的方法操作簡便,容易獲得高水平的瞬時沉默效果,特異性強。我們通過嚴格設(shè)計來增強siRNA的專一性;針對某靶基因設(shè)計的3條siRNA可保證其中兩條的Knockdown效率達到75%(在轉(zhuǎn)染效率大于80%的情況下)。
在RNAi效應階段,siRNA雙鏈結(jié)合一個核酶復合物從而形成所謂RNA誘導沉默復合物(RNA-induced silencing complex,RISC)。激活的RISC通過堿基配對定位到同源mRNA轉(zhuǎn)錄本上,并在距離siRNA 3’端12個堿基的位置切割mRNA。
▏ siRNA合成實驗流程
1)根據(jù)序列信息,進行化學合成;
2)純化及定量;
3)凍干處理;
4)細胞轉(zhuǎn)染預實驗,優(yōu)化轉(zhuǎn)染條件;
5)瞬時轉(zhuǎn)染或穩(wěn)定轉(zhuǎn)染;
6)RT-PCR或Western blot檢測轉(zhuǎn)染后某一時間點靶基因的RNA水平或蛋白水平的變化。
▏ 質(zhì)量保證
針對某靶基因設(shè)計的3條siRNA可保證其中2條的Knockdown效率達到75%(在轉(zhuǎn)染效率大于80%的情況下)。
▏ shRNA構(gòu)建服務(wù)
構(gòu)建shRNA表達載體,實現(xiàn)shRNA在細胞中穩(wěn)定表達,能夠彌補瞬時轉(zhuǎn)染持續(xù)時間短的不足。
▏ shRNA構(gòu)建實驗流程
1)mRNA序列分析;
2)引物設(shè)計及合成;
3)單鏈互補引物退火;
4)將片段克隆至載體;
5)測序以確保插入序列正確性;
6)細胞轉(zhuǎn)染預實驗,優(yōu)化轉(zhuǎn)染條件;
7)瞬時轉(zhuǎn)染或穩(wěn)定轉(zhuǎn)染;
8)RT-PCR或Western blot檢測轉(zhuǎn)染后某一時間點靶基因的RNA水平或蛋白水平的變化。
▏ 質(zhì)量保證
針對某靶基因設(shè)計的3條shRNA序列,在轉(zhuǎn)染效率>80%的前提下,我們保證至少有1個克隆可以達到70%轉(zhuǎn)錄水平的沉默效率。
▏ miRNA構(gòu)建服務(wù)
RNAi載體利用細胞內(nèi)源性的miRNA加工機制,相比傳統(tǒng)shRNA載體可更高效地表達RNA發(fā)夾結(jié)構(gòu),并具有采用GFP進行表達追蹤的優(yōu)點。每個基因設(shè)計的4條序列我們保證至少有2條可以達到至少70%轉(zhuǎn)錄水平的Knockdown效率(在轉(zhuǎn)染效率大于80%的情況下)。
▏ miRNA構(gòu)建實驗流程
1)針對特定基因,設(shè)計miR RNAi序列,合成該序列并退火生成雙鏈DNA;
2)將DNA與載體連接并轉(zhuǎn)化;
3)測序驗證miRNA序列的正確性;
4)細胞轉(zhuǎn)染預實驗,優(yōu)化轉(zhuǎn)染條件;
5)瞬時轉(zhuǎn)染或穩(wěn)定轉(zhuǎn)染;
6)RT-PCR或Western blot檢測轉(zhuǎn)染后某一時間點靶基因的RNA水平或蛋白水平的變化。
▏ 質(zhì)量保證
針對某靶基因設(shè)計的3條miRNA序列,在轉(zhuǎn)染效率>80%的前提下,我們保證至少有1個克隆可以達到70%轉(zhuǎn)錄水平的沉默效率。
▏ 客戶提供
1)目的基因的Accession Number(Human、Mouse或Rat種屬)以及技術(shù)要求(包括OD和nmols的精確數(shù)量、純化類型和修飾要求等);
2)細胞株和詳細的細胞培養(yǎng)的操作步驟;
3)一抗(如果需要Western blot檢測)。
▏ 服務(wù)說明
1. RNAi技術(shù)服務(wù)不包括基因功能檢測,如需檢測,需要另外評估和收費;
2. 客戶可以提供實驗原材料,也可以查找本公司模板庫、載體庫、細胞庫,也可以由我們公司代購;