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hCov-NL63-ORF1ab/RdRP Pseudovirus Standard Reference

CBV30017

詢 價(jià)
留 言
產(chǎn)品描述
產(chǎn)品數(shù)據(jù)庫

 

I. 背景

hCov-NL63最早是在2004年初在荷蘭從一個(gè)7個(gè)月大的嬰兒中從吸出物中分離出來的。此后,HCoV-NL63的感染已被證明是世界范圍內(nèi)普遍存在的疾病,并與許多臨床癥狀有關(guān)。診斷包括嚴(yán)重的下呼吸道感染,臀部炎和細(xì)支氣管炎。HCoV-NL63引起兒童疾病,老年人和免疫功能低下的兒童,在兒童呼吸道感染中占1.0-9.3%。

根據(jù)CDCWHO的介紹,針對HCoV-NL63的核酸診斷一般是針對RdRP (RNA-dependent RNA polymerase)、Gene N和Gene E, Gene S更多用于對應(yīng)藥物和疫苗的開發(fā)。NCBI收錄序列為JX504050.1,全長27553bp,基因編碼4個(gè)結(jié)構(gòu)蛋白:S,M,NE。

以往針對試劑盒檢測限的性能評價(jià),一般是選擇體外轉(zhuǎn)錄的RNA、或者臨床陽性病毒來作為標(biāo)準(zhǔn)品,用于性能評價(jià)。但是兩者都具有很明顯的確定,首先體外轉(zhuǎn)錄的RNA,一般是很純,單一,不涉及提取,不符合臨床病毒的微環(huán)境,因此必然造成檢測靈敏度被高估,這也是存在高概率假陰性的主要原因;再次臨床陽性病毒,即使是滅活的病毒,也是存在很大的生物安全隱患,因此要求實(shí)驗(yàn)室級別為P3-P4,大部分開發(fā)診斷試劑盒單位都不滿足改要求,另外臨床陽性病毒也是來源很有限,不能被穩(wěn)定供應(yīng),反復(fù)用于試劑盒的性能評價(jià)。

 
II.產(chǎn)品描述

有病毒的完整包膜結(jié)構(gòu),有HCoV-NL63對應(yīng)的核酸序列,但是生物安全風(fēng)險(xiǎn)較低的假病毒標(biāo)準(zhǔn)品,完美的克服了選擇體外轉(zhuǎn)錄的RNA、或者臨床陽性病毒來作為標(biāo)準(zhǔn)品的缺點(diǎn),非常適合用于核酸診斷性能評價(jià)的標(biāo)準(zhǔn)品。

構(gòu)建過程:HCoV-NL63基因合成→假病毒包裝→純化→QC檢測(ddPCR)

 
III. 產(chǎn)品介紹
產(chǎn)品名稱: hCov-NL63-ORF1ab/RdRP Pseudovirus Standard Reference
對應(yīng)序列(詳情見附錄):

ORF1ab/RdRP(2780bp)

產(chǎn)品規(guī)格: 1ml
拷貝數(shù): >1x10e7copies/ml
生物安全級別: P2
運(yùn)輸與保存方式: 干冰運(yùn)輸,-90 ~ -70°C保存
有效期:  
 
IV. 產(chǎn)品用途與優(yōu)勢
產(chǎn)品用途: HCoV-NL63診斷試劑盒性能評價(jià)
產(chǎn)品優(yōu)勢: HCoV-NL63的假病毒標(biāo)準(zhǔn)品,區(qū)別于以往體外合成的RNA、臨床陽性活病毒,完美克服兩者的缺點(diǎn),真正適合用于試劑盒的性能評價(jià),包含檢測限、特異性,重復(fù)性等;

• 根據(jù)HCoV-NL63冠狀病毒的特點(diǎn),選取了ORF1ab/RdRP(RNA-dependent RNA polymerase)、Gene E(envelope protein)、Gene N(nucleocapsid phosphoprotein)合計(jì)3個(gè)區(qū)段的序列,用于假病毒的包裝,3個(gè)區(qū)段很好的表征了HCoV-NL63的特征序列;

• 科佰生物設(shè)計(jì)了ddPCR體系的引物、探針序列,可不需要構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)曲線的前提下完成對假病毒的QC拷貝數(shù)檢測,非常準(zhǔn)確表征標(biāo)準(zhǔn)品的拷貝數(shù),而且克服了Q-PCR分析CT值的相對判斷標(biāo)準(zhǔn)的不準(zhǔn)確性;

• 假病毒標(biāo)準(zhǔn)品,無致病性,可再生,質(zhì)控方法可靠,批次間穩(wěn)定,可以長期穩(wěn)定制備和供應(yīng),而且要求實(shí)驗(yàn)室生物安全級別為P2,滿足很多單位的安全需求。

 
Ⅴ. 附錄

ORF1ab/RdRP:

1 agtgttgaca tttcttattt aaacgagcaa ggggttctag tgcagctcga ctagaaccct
       61 gtaatggcac ggacatcgat aagtgtgttc gtgcttttga catttataat aaaaatgttt
      121 cattcttggg taagtgtttg aagatgaact gtgttcgttt taaaaatgct gatcttaagg
      181 atggttattt tgttataaag aggtgtacta agtcggttat ggaacacgag caatccatgt
      241 ataacctact taacttttct ggtgctttgg ctgagcatga tttctttact tggaaagatg
      301 gcagagtcat ttatggtaat gttagtagac ataatcttac taaatatact atgatggact
      361 tggtctatgc tatgcgtaac tttgatgaac aaaattgtga tgttctaaaa gaagtattag
      421 ttttaactgg ttgttgtgac aattcttatt ttgatagtaa gggttggtat gacccagttg
      481 aaaatgaaga tatacataga gtttatgcat ctcttggcaa aattgtagct agagctatgc
      541 ttaaatgcgt tgctctatgt gatgcgatgg ttgctaaagg tgttgttggt gttttaacat
      601 tagataacca agatcttaat ggtaactttt atgattttgg tgattttgtt gttagcttac
      661 ctaatatggg tgttccctgt tgtacatcat attattctta tatgatgcct attatgggtt
      721 taactaattg tttagctagt gagtgttttg tcaagagtga tatttttggt agtgatttta
      781 aaacttttga tttgcttaag tatgatttca ctgaacataa agaaaattta ttcaataagt
      841 actttaagca ttggagtttt gattatcatc ctaattgtag tgactgttat gatgatatgt
      901 gtgttataca ttgtgctaat tttaatacac tatttgctac aactatacca ggtactgctt
      961 ttggtccact atgtcgtaaa gtttttatag atggtgttcc acttgttaca actgctggtt
     1021 atcattttaa gcaattaggt ttggtttgga ataaagatgt taacacacac tcagttaggt
     1081 tgacaattac tgaacttttg caatttgtca ccgacccttc cttgataata gcttcttccc
     1141 cagcactcgt tgatcaacgc actatttgtt tttctgttgc agcattgagt actggtttga
     1201 caaatcaagt tgttaagcca ggtcatttta atgaagagtt ttataacttt cttcgtttaa
     1261 gaggtttctt tgatgaaggt tctgaactta cattaaaaca tttcttcttc gcacagaatg
     1321 gtgatgctgc tgttaaagat tttgactttt accgttataa taagcctacc attttagata
     1381 tttgtcaagc tagagttaca tataagatag tctctcgtta ttttgacatt tatgaaggtg
     1441 gctgtattaa ggcatgtgaa gttgttgtaa caaatcttaa taagagtgct ggttggccat
     1501 taaataagtt tggtaaagct agtttgtatt atgaatctat atcttatgaa gaacaggatg
     1561 ctttgtttgc tttgacaaag cgtaatgtcc tccctactat gacacagctg aatcttaagt
     1621 atgctattag tggtaaagaa cgtgctagaa ctgttggtgg tgtttctctg ttgtctacaa
     1681 tgaccacaag acaataccat caaaaacatc ttaaatccat tgttaataca cgcaatgcca
     1741 ctgttgttat tggtactacc aaattttatg gtggttggaa taatatgttg cgtactttaa
     1801 ttgatggtgt tgaaaaccct atgctcatgg gttgggatta tcccaaatgt gatagagctt
     1861 tgcctaacat gatacgtatg atttcagcca tggtgttggg ctctaagcat gttaattgtt
     1921 gtactgcaac agataggttt tataggcttg gtaatgagtt ggcacaagtt ttaacagaag
     1981 ttgtttattc taatggtggt ttttatttta agccaggtgg tacgacttct ggtgacgcta
     2041 gtacagctta tgctaattct atttttaaca tttttcaagc cgtgagttct aacattaaca
     2101 ggttgcttag tgtcccatca gattcatgta ataatgttaa tgttagggat ctacaacgac
     2161 gtctgtatga taattgctat aggttaacta gtgttgaaga gtcattcatt gatgattatt
     2221 atggttatct taggaaacat ttttcaatga tgattctctc tgatgacggt gttgtctgtt
     2281 ataacaagga ttatgctgag ttaggttata tagcagacat tagtgctttt aaagccactt
     2341 tgtattacca gaataatgtc tttatgagta cttctaaatg ttgggttgaa gaagatttaa
     2401 ctaagggacc acatgagttt tgttcccagc atactatgca aatagttgac aaagatggta
     2461 cctattattt gccttaccca gatcctagta ggatcttgtc agctggtgtt tttgttgatg
     2521 atgttgttaa gacagatgct gttgttttgt tagaacgtta tgtgtcttta gctattgatg
     2581 cataccctct ttcaaaacac cctaattctg aatatcgcaa ggttttttac gtattacttg
     2641 attgggttaa gcatcttaac aaaaatttga atgagggtgt tcttgaatct ttttctgtta
     2701 cacttcttga taatcaagaa gataagtttt ggtgtgaaga tttttatgct agtatgtatg
     2761  aaaattctac aatattgcaa


 

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